MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit

Total Repeats: 5204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016012	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016012	TAT	2	6	1419	1424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016012	ATT	2	6	1454	1459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016012	T	6	6	1470	1475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016012	TA	3	6	1493	1498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016012	A	6	6	1498	1503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016012	CAA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016012	AAC	2	6	1522	1527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016012	TTA	2	6	1530	1535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016012	TAC	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016012	T	6	6	1551	1556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016012	ATT	2	6	1568	1573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016012	ATTTA	2	10	2717	2726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016012	ATA	2	6	2754	2759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016012	GGA	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016012	A	6	6	8524	8529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016012	TA	3	6	8553	8558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016012	ATA	2	6	8568	8573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016012	GTT	2	6	8583	8588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016012	CGGT	2	8	8637	8644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016012	CCA	2	6	8668	8673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016012	CCA	2	6	8745	8750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016012	A	7	7	9369	9375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016012	TAG	2	6	9386	9391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016012	AGG	2	6	10707	10712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016012	TAT	2	6	12330	12335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016012	T	6	6	12360	12365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016012	ATA	2	6	12374	12379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016012	GA	3	6	12395	12400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016012	GCGT	2	8	12437	12444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016012	CT	3	6	12473	12478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016012	AATT	2	8	12484	12491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016012	T	6	6	12490	12495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016012	A	7	7	12586	12592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016012	TTAAA	2	10	12601	12610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016012	T	7	7	12619	12625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016012	AAGA	2	8	12635	12642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016012	TA	3	6	12661	12666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016012	AATG	2	8	12676	12683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016012	ATTTT	2	10	12710	12719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016012	TA	3	6	20914	20919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016012	TAATA	2	10	20928	20937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016012	A	6	6	20945	20950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016012	TAATT	2	10	22782	22791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016012	ATA	2	6	22799	22804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016012	ATT	2	6	22822	22827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016012	TG	3	6	22898	22903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016012	TGA	2	6	22922	22927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016012	GGT	2	6	22944	22949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016012	T	6	6	22949	22954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016012	AT	3	6	22956	22961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016012	AGG	2	6	23038	23043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016012	ATA	2	6	23518	23523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016012	GAT	2	6	23553	23558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016012	T	6	6	23615	23620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016012	T	6	6	23645	23650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016012	TCG	2	6	23699	23704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016012	GAT	2	6	23745	23750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016012	TAT	2	6	23806	23811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016012	A	6	6	23941	23946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016012	ACC	2	6	24015	24020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016012	TGA	2	6	24025	24030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016012	TGC	2	6	24137	24142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016012	TTC	2	6	24143	24148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016012	CAT	2	6	24199	24204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016012	TTA	2	6	24269	24274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016012	TGT	2	6	24376	24381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016012	T	6	6	24393	24398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016012	AGC	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016012	TTC	2	6	24438	24443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016012	CGCA	2	8	24456	24463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016012	GCA	2	6	24469	24474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016012	AT	3	6	24500	24505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016012	TGTC	2	8	24596	24603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016012	ACA	2	6	24622	24627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016012	AAG	2	6	24638	24643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016012	TTG	2	6	24672	24677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016012	GTT	2	6	24728	24733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016012	ATA	2	6	24748	24753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016012	T	6	6	24763	24768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016012	TCT	2	6	24776	24781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016012	T	7	7	24830	24836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016012	T	6	6	24992	24997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016012	ATC	2	6	26836	26841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016012	TGT	2	6	26854	26859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016012	CCG	2	6	27163	27168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016012	AATA	2	8	27228	27235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016012	AAT	2	6	27240	27245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016012	T	6	6	27249	27254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016012	T	6	6	27303	27308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016012	ATG	2	6	27329	27334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016012	ATC	2	6	27362	27367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016012	TTA	2	6	27373	27378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016012	TAT	2	6	27956	27961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016012	GT	3	6	27987	27992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016012	T	6	6	28085	28090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016012	TAG	2	6	28105	28110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016012	T	7	7	28180	28186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016012	AT	3	6	28257	28262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016012	AAT	3	9	28297	28305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016012	CTT	2	6	28410	28415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016012	T	7	7	28414	28420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016012	AGT	2	6	28489	28494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016012	T	6	6	28576	28581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016012	CCA	2	6	28595	28600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016012	T	8	8	28628	28635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016012	TGC	2	6	28723	28728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016012	TGT	2	6	28737	28742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016012	ACTTC	2	10	28869	28878	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016012	TCT	2	6	28882	28887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016012	CTAT	2	8	29023	29030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016012	ATGT	2	8	29088	29095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016012	AGC	2	6	29108	29113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016012	GTC	2	6	29214	29219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016012	ATAG	2	8	29262	29269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016012	TGT	2	6	29317	29322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016012	CT	3	6	29377	29382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016012	CTT	2	6	29440	29445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016012	TGCC	2	8	29543	29550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016012	GAC	2	6	29631	29636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016012	TAT	2	6	29679	29684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016012	GTG	2	6	30025	30030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016012	AGT	2	6	30041	30046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016012	ATTT	2	8	30073	30080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016012	GCG	2	6	30208	30213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016012	TA	3	6	30297	30302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016012	TAG	2	6	30307	30312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016012	T	6	6	30345	30350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016012	GCA	2	6	30431	30436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016012	TCCT	2	8	30441	30448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016012	TACCT	2	10	30539	30548	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016012	TTG	2	6	30549	30554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016012	AGC	2	6	30566	30571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016012	ATT	2	6	30587	30592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016012	TTC	2	6	30597	30602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016012	CAT	2	6	30656	30661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016012	GTAT	2	8	30768	30775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016012	CTATA	2	10	31507	31516	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016012	AT	3	6	31570	31575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016012	TA	3	6	31623	31628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016012	CTT	2	6	31695	31700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016012	TG	3	6	31778	31783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016012	CAA	2	6	31834	31839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016012	TTTTC	2	10	31888	31897	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016012	TAT	2	6	31913	31918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016012	TGA	2	6	31981	31986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016012	TGG	2	6	32041	32046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016012	GAAAAA	2	12	32052	32063	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016012	GAG	2	6	32198	32203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016012	ATG	2	6	32208	32213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016012	TGT	2	6	38692	38697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_016012	TTTA	2	8	41019	41026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_016012	TATAT	2	10	43294	43303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_016012	TAGA	2	8	45964	45971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
185	NC_016012	GA	3	6	46023	46028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016012	GA	3	6	46031	46036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_016012	ATT	2	6	53334	53339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_016012	TAT	2	6	80401	80406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_016012	ATT	2	6	80407	80412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_016012	AG	3	6	80783	80788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
442	NC_016012	TAA	2	6	81186	81191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_016012	TAA	2	6	81193	81198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_016012	A	9	9	81197	81205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_016012	TAT	2	6	81219	81224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_016012	AG	3	6	81237	81242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
447	NC_016012	AGG	2	6	81876	81881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_016012	TA	3	6	83091	83096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_016012	TA	3	6	83119	83124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_016012	AT	3	6	83781	83786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_016012	TAT	2	6	86587	86592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_016012	TAT	2	6	86605	86610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_016012	AATA	2	8	88341	88348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_016012	T	6	6	95273	95278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_016012	TTA	2	6	106475	106480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_016012	TA	3	6	106499	106504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_016012	TTA	2	6	106505	106510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_016012	TAA	2	6	106513	106518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_016012	AT	5	10	112531	112540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_016012	TA	3	6	112574	112579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_016012	GTA	2	6	112580	112585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_016012	AATT	2	8	114117	114124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_016012	A	7	7	114633	114639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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